Farlutal também é indicado para amenorreia secundária, tratamento de hemorragia uterina disfuncional devido a desequilíbrio hormonal, na ausência de patologias orgânicas, tais como mioma ou carcinoma uterino. Farlutal é contraindicado a pacientes que apresentam tromboflebites, distúrbios tromboembólicos, aborto retido, insuficiência hepática grave, hipersensibilidade conhecida ao acetato de medroxiprogesterona ou a qualquer componente da fórmula, hipercalcemia no caso de pacientes portadores de metástases ósseas. Também é contraindicado no caso de presença ou suspeita de doença maligna da mama ou da genitália, sangramento vaginal de causa não diagnosticada e varizes.